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🔄 Actualizado: 18/09/2026

La implementación de Microsoft Defender for Endpoint con Intune es uno de los pasos más importantes para reforzar la seguridad de los dispositivos conectados (endpoints) en entornos corporativos que trabajan con Microsoft 365.

Al combinar la potencia de detección y respuesta (EDR) de Defender con las capacidades de gestión de dispositivos de Intune, se crea un ecosistema robusto que garantiza que solo los dispositivos conformes y protegidos accedan a los recursos corporativos.

Por qué integrar Microsoft Defender for Endpoint con Intune

Integrar Microsoft Defender for Endpoint (MDE) con Intune aporta una respuesta completa de seguridad en los dispositivos de las empresas. Estas son las ventajas principales:

  • Sistema híbrido de defensa: Combina la detección avanzada de amenazas con la gestión y respuesta automatizada.
  • Despliegue automatizado: Olvídate de scripts complejos; Intune despliega el agente de Defender de forma silenciosa en toda tu flota de dispositivos.
  • Cumplimiento basado en riesgo: Puedes establecer políticas de acceso condicional. Si Defender detecta una amenaza en un equipo, Intune lo marca como «no conforme» y bloquea su acceso a Outlook o SharePoint hasta que esté limpio.
  • Gestión centralizada: Visualiza el estado de salud de tus dispositivos y las alertas de seguridad desde un único ecosistema, facilitando la labor del equipo de IT.
  • Multiplataforma: Ofrece protección integral para los principales sistemas operativos, incluyendo Windows, Windows Server, macOS, Linux, Android y iOS.

Cómo funciona la implementación de Microsoft Defender for Endpoint con Intune

La implementación de Microsoft Defender for Endpoint con Intune se basa en establecer un handshake (“apretón de manos») entre ambos servicios y luego dictar las reglas de comportamiento para los dispositivos. Es un proceso comparable a cuando te conectas a internet, donde también se produce un handshake de seguridad entre tu dispositivo y el router, o entre tu dispositivo y los certificados de las webs que visitas, pero con más capas de seguridad.

Cómo implementar Microsoft Defender for Endpoint con Intune paso a paso

A continuación, te contamos cómo implementar Microsoft Defender for Endpoint con Intune, alineado con las buenas prácticas y el flujo recomendado por Microsoft.

1. Integración inicial en Microsoft 365 Defender

El primer paso consiste en habilitar la integración entre Defender for Endpoint e Intune desde el entorno de administración de Microsoft 365. Esta integración permite que Defender comparta información de riesgo del dispositivo con Intune, lo que será clave para aplicar respuestas automáticas.

Para ello, sigue estos pasos:

  1. Desde el panel principal de Microsoft 365 ve a “Seguridad” (en el panel lateral izquierdo) para acceder al Centro de administración de Microsoft 365 Defender.
  2. Ve a “Configuración” > “Puntos de conexión” > “Características avanzadas”.
  3. Haz scroll hacia abajo y activa la opción de “Conexión a Microsoft Intune”.
  4. Pulsa sobre el botón de “Guardar preferencias”.
Integración de Microsoft Defender for Endpoint con Microsoft Intune desde el centro de administración de Microsoft 365 Defender para compartir información de riesgo del dispositivo

Activación de la conexión entre Defender for Endpoint e Intune.

2. Configuración en Microsoft Intune

Una vez habilitada la integración, el siguiente paso es configurar Intune para desplegar Microsoft Defender for Endpoint en los dispositivos. Para ello, sigue estos pasos:

1. Desde el Centro de administración de Microsoft 365, pulsa sobre “Mostrar todo” y accede al portal “Endpoint Manager”.

2. Una vez dentro, ve a “Seguridad de los puntos de conexión”, en el panel lateral izquierdo.

Estado de sincronización disponible entre Microsoft Defender for Endpoint y Microsoft Endpoint Manager tras la integración, con opción de actualizar para refrescar los datos

3. Desde aquí, podremos ver el estado de sincronización entre los portales de Microsoft Defender for Endpoint y Endpoint Manager. Tras la configuración que hemos realizado, podremos ver que el estado está marcado como “Disponible”. Si no aparece como “Disponible”, pulsa sobre el botón superior “Actualizar” para refrescar los datos.

Activación de políticas de seguridad y conexión de dispositivos Windows en Microsoft Defender for Endpoint desde la integración con Microsoft Intune para aplicar configuraciones de protección del punto de conexión

4. A continuación, marcamos sobre “Activado” en la primera opción “Permitir que Microsoft Defender for Endpoint aplique las configuraciones de seguridad de punto de conexión” y las que deseemos de la lista inferior. En nuestro caso, vamos a activar también “Conectar dispositivos Windows a Microsoft Defender for Endpoint”.

5. Finaliza pulsando sobre “Guardar” (junto al botón anterior de “Actualizar”).

Guardado de la configuración de integración entre Microsoft Defender for Endpoint y Microsoft Intune tras activar las opciones de seguridad del punto de conexión

Después, configuramos la directiva de cumplimiento, para poder marcar un dispositivo como “Conforme” o “Inconforme” en función de su nivel de seguridad. Para ello, sigue estos pasos:

6. Desde el Centro de administración de Microsoft 365, pulsa sobre “Mostrar todo” y volvemos a acceder al portal “Endpoint Manager”.

7. Una vez dentro, ve a “Dispositivos”, en el panel lateral izquierdo.

8. A continuación, pulsa sobre “Directivas de cumplimiento”.

Creación de una directiva en Microsoft Intune seleccionando la plataforma Windows 10 y posteriores para aplicar políticas de seguridad

9. Pulsamos sobre “Crear directiva”.

10. En el panel lateral elegiremos la plataforma (en nuestro caso, “Windows 10 y posteriores”).

11. Pulsamos sobre “Crear”.

Creación de una directiva en Microsoft Intune seleccionando la plataforma Windows 10 y posteriores para aplicar políticas de seguridad

12. En la pestaña “Básico”, asignamos un nombre y pulsamos sobre “Siguiente”.

Configuración básica de una directiva en Microsoft Intune asignando nombre y avanzando al siguiente paso de la creación de políticas

13. En la pestaña “Configuración de cumplimiento”, podremos asignar varios parámetros de asignación (como por ejemplo, la versión mínima del sistema operativo). En nuestro caso, nos interesa la opción “Microsoft Defender for Endpoint”. Desplegamos la pestaña y podremos establecer un nivel mínimo de puntuación de riesgo del dispositivo para que la directiva se aplique como “Conforme”. Recomendamos la opción “Borrar” (que significa que el dispositivo tiene que estar limpio). Pulsamos sobre “Siguiente”.

Configuración de cumplimiento en Microsoft Intune usando Microsoft Defender for Endpoint para definir un nivel mínimo de riesgo del dispositivo y marcarlo como conforme

14. En la pestaña “Acciones en caso de incumplimiento”, podemos decidir qué hacer con los dispositivos inconformes (podemos dejarlo por defecto).

Configuración de acciones en caso de incumplimiento en Microsoft Intune para definir el comportamiento de los dispositivos no conformes con la directiva

15. En la pestaña “Asignaciones”, fijamos a qué usuarios afectará esta directiva. Recomendamos aplicarla a todos (haciendo clic en “Agregar a todos los usuarios”).

Asignación de una directiva de cumplimiento en Microsoft Intune a los usuarios, recomendando aplicarla a todos para una protección uniforme

16. En la pestaña “Revisar y crear”, veremos un resumen de la directiva que estamos generando. Si todo está correcto, pulsamos sobre “Crear”.

Revisión final y creación de una directiva de cumplimiento en Microsoft Intune tras validar la configuración y los parámetros definidos

Ya solo queda configurar el perfil de configuración, que nos permitirá establecer la comunicación entre nuestros equipos y Microsoft Defender. Para ello, sigue estos pasos:

17. Desde el Centro de administración de Microsoft 365, pulsa sobre “Mostrar todo” y accedemos de nuevo al portal “Endpoint Manager”.

18. Una vez dentro, volvemos a acceder a “Dispositivos”, en el panel lateral izquierdo.

19. A continuación, pulsa sobre “Perfiles de configuración”.

Acceso a perfiles de configuración desde el portal de Microsoft Endpoint Manager a través del Centro de administración de Microsoft 365 para gestionar dispositivos en Intune

20. Pulsamos sobre “Crear perfil”.

21. En el panel lateral elegiremos la plataforma (en nuestro caso, “Windows 10 y posteriores”).

22. En el desplegable “Tipo de perfil” seleccionamos “Plantillas”.

23. Se desplegará una nueva lista de opciones. Seleccionamos “Microsoft Defender para punto de conexión (…)”.

24. Pulsamos sobre “Crear”.

Creación de un perfil de configuración en Microsoft Intune seleccionando la plantilla de Microsoft Defender for Endpoint para Windows 10 y posteriores

25. En la pestaña “Básico”, asignamos un nombre y pulsamos sobre “Siguiente”.

Configuración básica de un perfil de seguridad en Microsoft Intune asignando un nombre antes de continuar con la creación

26. En la pestaña “Opciones de configuración”, deberemos activar la opción “Frecuencia de informes de telemetría urgentes”.

Activación de la frecuencia de informes de telemetría urgentes en Microsoft Intune para mejorar la respuesta de Microsoft Defender for Endpoint ante incidentes

27. En la pestaña “Asignaciones”, volvemos a fijar a qué usuarios afectará este perfil. Recomendamos aplicarla a todos (haciendo clic en “Agregar a todos los usuarios”).

Asignación de un perfil de configuración en Microsoft Intune a todos los usuarios para aplicar las opciones de seguridad de forma global

28. En la pestaña “Reglas de aplicabilidad”, elegiremos a qué versión de sistema operativo afecta este perfil: Regla: “Asignar perfil si” / Propiedad: “Edición del sistema operativo” / Valor: Seleccionamos todos.

Configuración de reglas de aplicabilidad en Microsoft Intune para asignar el perfil según la edición del sistema operativo en dispositivos Windows

29. En la pestaña “Revisar y crear”, veremos un resumen del perfil que estamos generando. Si todo está correcto, pulsamos sobre “Crear”.

Revisión final y creación de un perfil de configuración en Microsoft Intune tras validar las opciones y reglas definidas

3. Verificación

Tan importante es configurar como comprobar que el despliegue funciona correctamente.

  • En el portal de Intune: Revisa el estado de la política de EDR que creaste. Deberías ver dispositivos en estado «Correcto» o «Succeeded».
  • En el dispositivo local: Puedes ejecutar el comando sc query sense en el CMD con permisos de administrador para confirmar que el servicio de Defender está funcionando (la respuesta debería ser RUNNING).
  • Prueba de detección: Microsoft ofrece un script de prueba de onboarding que genera una alerta inofensiva en el portal de Defender para confirmar que la comunicación es total.

Recuerda que en BiMind somos Premium Partner de Microsoft y podemos ayudarte con los primeros pasos para configurar tus productos de la suite de Microsoft en tu empresa. ¡Contáctanos si lo necesitas!

Aquí te dejamos un tutorial en vídeo para que puedas seguir paso a paso todo el proceso con éxito:

Recursos adicionales

Para profundizar en configuraciones avanzadas o resolución de problemas, recomendamos consultar la documentación oficial y herramientas de la comunidad:

Preguntas frecuentes

¿Qué licencias son necesarias para usar Microsoft Defender for Endpoint con Intune?

Es necesario disponer de licencias que incluyan Microsoft Defender for Endpoint (por ejemplo, Microsoft 365 E3, E5 o F3 o Defender for Endpoint P2) y licencias de Intune para la gestión de dispositivos.

¿Se puede implementar Microsoft Defender for Endpoint sin Intune?

Sí, pero al hacerlo con Intune se obtiene una gestión centralizada y automatizada mucho más eficiente.

¿Qué dispositivos se pueden proteger?

La integración permite proteger dispositivos Windows, Windows Server, macOS, Linux, Android y iOS, según el nivel de licencia y configuración.

¿Cuánto tiempo tarda la implementación?

En entornos estándar, una implementación básica puede completarse en pocas horas, aunque el ajuste fino de políticas puede llevar más de una semana. A esos plazos habría que sumar la puesta en marcha y las pruebas de uso y seguridad en usuarios reales, que podrían alargarse de dos a cuatro semanas más.

¿Es recomendable hacer un piloto antes del despliegue global?

Sí, siempre es recomendable empezar con un grupo piloto para validar configuraciones y minimizar riesgos antes de escalar la solución.

Víctor García

Autor Víctor García

CEO BiMind | IT & Security | Consultor en servicios y tecnologías de la información | Experto en Microsoft 365, Azure e Ivanti Neurons

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